自2000成立以来，中心依托三个省级重点学科（生态学、物化学和分子生物学、植物学（含动物学））、两个省级重点实验室（安徽省重要生物资源保护与利用重点实验室、生物环境与生态安全安徽省重点实验室）、一个省级数字化公共服务平台（安徽省生物标本资源数字化公共服务平台）和一个省级工程中心（安徽省中药日化工程中心），以及日元贷款、国家西部高校基础能力建设、生物科学国家级特色专业建设等平台和项目经费的支撑，仪器设备的数量和质量均能地满足教学要求，并保持着高效运行状态。实现了在安徽省省属高校同类实验中心仪器设备添置、更新和使用率的领先地位。具体地说，基础实验课程仪器设备每人一套；综合型实验根据实验需要分组开展，仪器设备每组一套。

2013年安徽省高校实施提升和振兴计划， 生物学实验教学中心获得3年900万的仪器设备资助。